Pemilihan kombinasi tumpang sari yang tepat dapat memudahkan kontrol hama dan penyakit.
Namun, jika pola tanamnya tidak sesuai, hama yang menyerang satu jenis tanaman bisa menyebar ke tanaman lainnya.
Oleh karena itu, petani diimbau untuk memperhatikan kecocokan tanaman serta kebutuhan pestisida agar seluruh tanaman dalam tumpang sari dapat tumbuh optimal.