Terganggunya sistem pencernaan dapat terjadi apabila petai tidak diolah dengan benar. Pengolahan petai yang salah dapat membuat tubuh ibu hamil kesulitan memecah karbohidrat kompleks dalam petai.
Pada akhirnya, petai dapat mengganggu sistem pencernaan.
• Mengganggu kinerja ginjal
Kembali pada efek samping dari memakan petai berlebihan, petai dapat mengganggu kinerja ginjal. Kondisi ini karena kandungan protein tinggi pada petai yang membuat ginjal perlu bekerja lebih berat dari seharusnya.